物理フォーマットツール
PowerMax
http://cowscorpion.com/HDD/PowerMax.html

1：もし不良セクタ等があって、普通のフォーマットでは問題が解決しなかった
2：セキュリティの面から過去のデータをきれいさっぱりなくしたいと思っている
という目的の場合は、物理フォーマットがわりとカンタンで威力があると思います。

方法はそう難しくなく、HDDのメーカーにある「物理フォーマットツール」をダウンローとして使うか、HDDのメーカーがわからなければMaxtorの物理フォーマットツール（http://shattered04.myftp.org/pc_27.html）をダウンロードして使うことになります。
■ PowerMax とは？

PowerMaxはMaxtorから出ているHDD診断ツールです。
フロッピーを作成して実行します。
診断や物理フォーマット(ローレベルフォーマット)が可能です。

対象はMaxtor及びQuantumのHDDであり、
500MB以上のATA(IDE)HDDに対して使用可能です。

FD(フロッピーディスク)さえ作ってしまえば、そこから起動しますのでOSは関係ありませんが、
FDを作成するための環境は
Windows NT, Windows XP Home Edition, Windows 2000
Windows Me, Windows 98, Windows 95B, OS/2
となっています。

下記の機能を有しています。

・Basic Quick (90 Second) Test – 簡易診断
・Advanced Test (Full Scan Test) – 詳細診断
・Burn In Test – 診断の繰り返し
・Low Level Format (Full) – 全領域を物理フォーマット(ローレベルフォーマット)
・Low Level Format (Quick) – 一部領域を物理フォーマット(ローレベルフォーマット)

http://shattered04.myftp.org/pc_27.html